**前作「東方星母録」との違い -基本的なシステム周りやグラフィック、エフェクトなどはMOTHER3がベースになった。 --回復の仕様も変更されており、前作で役に立った余計に回復してシールドとして使うテクが使えなくなり、またダメージでHPが減少中に回復を行うと、回復を行った地点でのHPに対して回復が行われ、残っていたダメージは無視されるようになった(ただしこれはMOTHER3ではなく、MOTHER2の仕様である)。 -シナリオもMOTHER3同様、章立てのシナリオとなった。 -キャラクターのドット絵が新たに書き直された。 -セーブポイントが「カエルのぼうし」から「Sテル」に変更された。 -会話ウィンドウにキャラクターのアイコンが表示されるようになった。 -サウンドバトルが実装された。 -戦闘時にアイテムが使用可能になった。 -「にげる」コマンドが実装された。 -戦闘時に一時的に仲間になるNPCのアイコンが表示されなくなった。 -本家と同様、回復・補助系PSIの頭に「PK」がつかなくなった。