clade @ ウィキ
http://w.atwiki.jp/clade/
clade @ ウィキ
ja
2010-06-12T02:33:41+09:00
1276277621
-
ISOP分類
https://w.atwiki.jp/clade/pages/88.html
*ISOP (国際原生生物学会) の分類
〈〉内は、本ページで追加したシノニムです。
**Super‐groupsまで
真核生物
+アメーボゾア / アメーバ動物 (Amoebozoa)
+オピストコンタ / 後方鞭毛類 / 後方鞭毛虫 / 後方鞭毛生物 (Opisthokonta / 〈Opisthokonts〉)
+リザリア (Rhizaria)
+“アーケプラスティダ” / “古色素体類” (Archaeplastida) / (広義の)植物 (〈Plantae〉)
+クロマルベオラータ / クロモアルベオラータ (Chromalveolata)
+エクスカベート / エクスカヴァータ / “エクスカバータ” (Excavata)
**First rankまで
真核生物
+アメーボゾア / アメーバ動物 (Amoebozoa)
++ツブリナ綱 / ツブリネア (Tubulinea)
++フラベリナ綱 / フラベリネア (Flabellinea)
++ステレオミクサ目 (Stereomyxida)
++アカントアメーバ科 / アカンタメーバ科 (Acanthamoebidae)
++エントアメーバ科 / エンタメーバ科 (Entamoebidae)
++マスチゴアメーバ科 (Mastigamoebidae)
++ペロミクサ (&font(i){Peromyxa} / Pelobiontida)
++真正動菌 (Eumycetozoa) / 動菌 (Mycetozoa)
+-Incertae sedis Amoebazoa: フィラメーバ (&font(i){Filamoeba}), ゴセビア (&font(i){Gocevia}), “ハートマニア” (&font(i){Hartmannia}) [アカバナ (&font(i){Hartmannia}) とはホモニム], “ジャニッキア” (&font(i){Janickia}), “マラメーバ” (&font(i){Malamoeba}), “マルピガメーバ” (&font(i){Malpigamoeba}), “マルチシリア” (&font(i){Multicilia}), スティガメーバ (&font(i){Stygamoeba}).
+-Ince
2010-06-12T02:33:41+09:00
1276277621
-
リンク
https://w.atwiki.jp/clade/pages/87.html
*全生物の系統・分類を扱ったページ
****[[きまぐれ生物学: 生物分類表>http://www2.tba.t-com.ne.jp/nakada/takashi/taxonomy/taxonomy.html]]
****[[hilihili: 身近な系統樹>http://www5b.biglobe.ne.jp/~hilihili/keitou/mizika/mizika-top.html]]
****[[渡邊 誠一郎 ( Sei-ichiro Watanabe): 生物の系譜(系統分類)>http://epp.eps.nagoya-u.ac.jp/~seicoro/bio/]]
****[[PALAEOS: The Trace of Life on Earth: Life on Earth>http://palaeos.com/Kingdoms/default.htm]] &color(black){[en]}
****[[Wikipedia: 生物の分類>http://ja.wikipedia.org/wiki/%E7%94%9F%E7%89%A9%E3%81%AE%E5%88%86%E9%A1%9E]]
****[[Wikispecies>http://species.wikipedia.org/wiki/%E3%83%A1%E3%82%A4%E3%83%B3%E3%83%9A%E3%83%BC%E3%82%B8]] &color(black){[en, トップのみ多国語]}
****[[NCBI: Taxonomy browser>http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Root&id=1&lvl=3&lin=f&keep=1&srchmode=1&unlock]] &color(black){[en]}
****[[BI:202: Taxa of Life>http://comenius.susqu.edu/BI/202/Taxa.htm]] &color(black){[en]}
****[[Tree of Life Web Project>http://www.tolweb.org/tree/]] &color(black){[en]}
****[[S
2010-06-12T02:33:28+09:00
1276277608
-
霊長類
https://w.atwiki.jp/clade/pages/86.html
↑[[真主齧類]]
*現生グループの系統
霊長類 / サル目 (Primates) / 真霊長類 (Euprimates)
+曲鼻類 / 曲鼻猿類 (Strepsirrhini)
+直鼻類 / 直鼻猿類 (Haplorrhini)
++メガネザル型類 / メガネザル下目 (Tarsiiformes)
++真猿類 (Anthropoidea)
+++広鼻猿類 / 広鼻類 (Platyrrhini) / 新世界ザル
+++狭鼻猿類 / 狭鼻類 (Catarrhini)
++++オナガザル上科 (Cercopithecoidea) / 旧世界ザル
++++ヒト上科 (Hominoidea)
+++++テナガザル科 (Hylobatidae)
+++++ヒト科 (Hominidae)
++++++オランウータン亜科 (Ponginae)
++++++ヒト亜科 (Homininae)
+++++++ゴリラ (&font(i){Gorilla})
+++++++ヒト上族 (Homininu)
++++++++チンパンジー属 (&font(i){Pan})
++++++++ヒト族 (Hominini)
基底部分はレトロポソン (Alu-SINE) などによります。
シーケンス解析などでは
+原猿類 (Prosimii)
++曲鼻類 / 曲鼻猿類 (Strepsirrhini)
++メガネザル型類 / メガネザル下目 (Tarsiiformes)
+N.N.
++皮翼類 (Dermoptera) = ヒヨケザル目
++真猿類 (Anthropoidea)
のような結果も出ています。
-[[Schmitz et al. 2005. Primate phylogeny: molecular evidence from retroposons.>>http://zmbe2.uni-muenster.de/expath/articles/21_SchmitzCGR2005.pdf]]
*絶滅群を一部記載
霊長類 / サル目 (Primates)
+†プルガトリウス (&italic(){Purgatorius})
+N.N.
++†ミクロモミス科 (Micromomyidae)
++N.N.
+++†ミクロシ
2010-06-12T02:31:34+09:00
1276277494
-
真主齧類
https://w.atwiki.jp/clade/pages/85.html
↑[[有胎盤類]]
*Martin 2008
真主齧類 / 正主齧類 / 正主齧歯類 / ユーアルコントグリレス (Euarchontoglires) = 超霊長類 (Supraprimates) = Group III
+グリレス / グリス獣 (Glires)
++ウサギ目 / 兎目 (Lagomorpha)
++[[齧歯類]] (Rodentia) = ネズミ目
+ユーアルコンタ / 真主獣類 (Euarchonta)
++N.N.
+++登木類 (Scandentia) = ツパイ目
+++皮翼類 (Dermoptera) = ヒヨケザル目
++[[霊長類]] (Primates) = サル目
ユーアルコンタ、「登木類 + 皮翼類」の単系統性には異説もありますが、Martin や Nie et al. 2008 に従い、これらを単系統としました。
-[[Martin 2008. Colugos: obscure mammals glide into the evolutionary limelight>>http://jbiol.com/content/7/4/13/abstract]]
-[[Nie et al. 2008. Flying lemurs – The 'flying tree shrews'? Molecular cytogenetic evidence for a Scandentia-Dermoptera sister clade.>>http://www.biomedcentral.com/1741-7007/6/18]]
*Janecka et al. 2007
真主齧類 / 正主齧類 / 正主齧歯類 / ユーアルコントグリレス (Euarchontoglires) = 超霊長類 (Supraprimates) = Group III
+グリレス / グリス獣 (Glires)
++ウサギ目 / 兎目 (Lagomorpha)
++[[齧歯類]] (Rodentia) = ネズミ目
+ユーアルコンタ / 真主獣類 (Euarchonta)
++登木類 (Scandentia) = ツパイ目
++&font(i){霊長形類} (Primatomorpha) = 広義の霊長類 (Pri
2010-06-12T02:31:18+09:00
1276277478
-
鯨類
https://w.atwiki.jp/clade/pages/84.html
↑[[鯨偶蹄類]]
*鯨類の系統
鯨類 / クジラ類 (Cetacea)
+†パキケトゥス科 / パキシータス科 (Pakicetidae)
+真鯨類
++†アンブロケトゥス科 / アンブロシータス科 (Ambulocetidae)
++N.N.
+++†レミングトノケトゥス科 (Remingtonocetidae) ⊃ダラニステス (&italic(){Dalanistes})
+++広義のプロトケトゥス科 (Protocetidae &font(i){sensu lato})
++++†アルティオケトゥス (&font(i){Artiocetus})
++++N.N.
+++++†ロドケトゥス / ロドホシータス (&font(i){Rodhocetus})
+++++N.N.
++++++†クイスラケトゥス (&font(i){Quisracetus})
++++++†タクラケトゥス / タクラシータス (&font(i){Takracetus})
++++++N.N.
+++++++†ガウィオケトゥス / ガウィオシータス (&font(i){Gaviocetus}) = ガヴィアケトゥス (&font(i){Gaviacetus})
+++++++N.N.
++++++++†狭義のプロトケトゥス科 (Protocetidae &font(i){sensu} O’Leary)
++++++++†&font(i){カロライナケトゥス} (&font(i){Carolinacetus})
++++++++N.N.
+++++++++†ジョージアケトゥス / ゲオルギアケトゥス (&font(i){Georgiacetus})
+++++++++†バビアケトゥス (&font(i){Babiacetus})
+++++++++N.N.
++++++++++†エオケトゥス (&font(i){Eocetus})
++++++++++広義のバシロサウルス科 (Basilosauridae emend. Barnes & Mitchell, 1978)
+++++++++++†バシロサウルス亜科 (Basilosaurinae)
+++++++++++N.N.
++++++++++++†ドルドン亜科 (Dorud
2010-06-12T02:31:06+09:00
1276277466
-
鯨偶蹄類
https://w.atwiki.jp/clade/pages/83.html
↑[[ローラシア獣]]
*現生群の系統
鯨偶蹄類 / クジラ偶蹄類 / 偶蹄鯨類 / 偶蹄クジラ類 (Cetartiodactyla)
+核脚類 (Tylopoda) →ラクダ
+N.N.
++猪豚類 / イノシシ類 (Suina = Suiformes)
++鯨反芻類 (Cetruminantia)
+++反芻類 (Ruminantia) →ウシ
+++&font(i){ケタンコドンタ} / &font(i){鯨凹歯類} (Cetancodonta) = &font(i){鯨河馬形類} (Whippomorpha)
++++カバ類 (Ancodonta) = カバ上科 (Anthracotheroidea) = カバ科 (Hippopotamidae)
++++[[鯨類]] / クジラ類 (Cetacea)
鯨類以外を偶蹄類 (Artiodactyle) と呼びますが、側系統です。
かつては「猪豚類 + カバ科」はイノシシ亜目 (Suiformes) とされていましたが、多系統です。
*絶滅群の系統
鯨偶蹄類 / クジラ偶蹄類 / 偶蹄鯨類 / 偶蹄クジラ類 (Cetartiodactyla)
+ディコブネ科 (Dichobunidae)
+核脚類 (Tylopoda)
++†ジフォドン科 (Xiphodontidae)
++†オレオドンタ (&font(i){Oreodonta})
++†メリコイドドン科 (Merycoidodontidae) = メリコイドドン上科 (Merycoidodontoidea)
++†プロトケラス (&font(i){Protoceras}) = プロトケラス亜科 (Protoceratinae) = プロトケラス科 (Protoceratidae) = プロトケラス上科 (Protoceratoidea)
++ラクダ上科 (Cameloidea)
+{鯨反芻類 + 猪豚類}
++猪豚類 / イノシシ類 (Suina = Suiformes)
+++†&font(i){アクシイリア} (&font(i){Aksyiria})
+++†ラオエラ (&font(i){Raoella}) / ラオエラ科 (Raoellidae)
+++†コエロポタムス科 (Choeropo
2010-06-12T02:30:52+09:00
1276277452
-
翼手類
https://w.atwiki.jp/clade/pages/82.html
↑[[ローラシア獣類]]
*現生翼手類の系統
翼手類 (Chiroptera) = コウモリ
+&italic(){陰翼翼手類} (Yinpterochiroptera) = &font(i){オオコウモリ型類} (Pteropodiformes)
++大翼手類 / オオコオモリ (Megachiroptera) = オオコウモリ上科 (Pteropodoidea)= オオコウモリ科 (Pteropodidae)
++キクガシラコウモリ上科 (Rhinolophoidea)
+++N.N.
++++オナガコウモリ科 (Rhinopomatidae) = オナガコウモリ属 (&font(i){Rhinopoma})
++++N.N.
+++++ブタバナコウモリ科 (Craseonycteridae) = ブタバナコウモリ (&font(i){Craseonycteris thonglongyai})
+++++アラコウモリ科 (Megadermatidae)
+++キクガシラコウモリ科 (Rhinolophidae)
++++狭義のキクガシラコウモリ科 (Rhinolophidae &italic(){sensu stricto}) = キクガシラコウモリ亜科 (Rhinolophinae)
++++カグラコウモリ科 (Hipposideridae) = &italic(){カグラコウモリ亜科} (Hipposiderinae)
+陽翼手類 (Yangochiroptera) = &font(i){ヒナコウモリ型類} (Vespertilioniformes)
+++アシナガコウモリ科 (Natalidae)
++ヒナコウモリ上科 (Vespertilionoidea) - アシナガコウモリ科
+++オヒキコウモリ科 (Molossidae)
+++ヒナコウモリ科 (Vespertilionidae)
++++狭義のヒナコウモリ科 (Vespertilionidae &italic(){sensu stricro})
++++ユビナガコウモリ科 (Miniopteridae)
++サラモチコウモリ科 (Myzopodidae) = サラモチコウモリ (&font(i){Myzopoda aurita})
++ウオクイコウモリ
2010-06-12T02:30:36+09:00
1276277436
-
鰭脚類
https://w.atwiki.jp/clade/pages/81.html
↑[[食肉類]]
*鰭脚類の系統
鰭脚類 (Pinnipedia = Pinnipedimorpha) = アザラシ上科 (Phocoidea)
+&italic(){オタリア上科} (Otarioidea)
++セイウチ科 (Odobenidae)
+++†イマゴタリア (&italic(){Imagotaria downsi})
+++セイウチ (&italic(){Odobenus rosmarus})
++アシカ科 / オタリア科 (Otariidae)
+++キタオットセイ (&italic(){Callorhinus ursinus})
+++N.N.
++++オーストラリアアシカ (&italic(){Neophoca cinerea})
++++オタリア (&italic(){Otaria flavescens})
++++ミナミアフリカオットセイ (&italic(){Arctocephalus pusillus})
++++ニュージーランドアシカ (&italic(){Phocarctos hookeri} = &italic(){Arctocephalus hookeri})
++++N.N.
+++++ニュージーランドオットセイ (&italic(){Arctocephalus forsteri})
+++++N.N.
++++++ミナミアメリカオットセイ (&italic(){Arctocephalus australis})
++++++ガラパゴスオットセイ (&italic(){Arctocephalus galapagoensis})
++++N.N.
+++++ナンキョクオットセイ (&italic(){Arctocephalus gazella})
+++++アナンキョクオットセイ (&italic(){Arctocephalus tropicalis})
++++N.N.
+++++フェルナンデスオットセイ (&italic(){Arctocephalus philippii})
+++++グアダルーペオットセイ (&italic(){Arctocephalus townsendi})
++++アシカ属 + トド
+++++トド (&italic(){Eumetopias
2010-06-12T02:30:22+09:00
1276277422
-
クマ科
https://w.atwiki.jp/clade/pages/80.html
↑[[食肉類]]
*Krause et al. 2008
クマ科 (Ursidae)
+ ジャイアントパンダ科 (Ailuropodidae) = ジャイアントパンダ亜科 (Ailuropodinae) = ジャイアントパンダ属 (&italic(){Ailuropoda})
+狭義のクマ科
++メガネグマ亜科 (Tremarctinae)
+++メガネグマ属 (&italic(){Tremarctos})
+++†&italic(){ショートフェイスベア属} (&italic(){Arctodus})
++クマ亜科 (Ursinae) = クマ属 (&italic(){Ursus sensu} Hall 1981)
+++N.N.
++++N.N.
+++++マレーグマ (&italic(){Ursus malayanus} = &italic(){Helarctos} = &italic(){Helarctos malayanus})
+++++N.N.
++++++アメリカグマ (&italic(){Ursus americanus} = &italic(){Euarctos} = &italic(){Euarctos americanus})
++++++ツキノワグマ (&italic(){Ursus thibetanus} = &italic(){Selenarctos} = &italic(){Selenarctos thibethanus})
++++狭義のクマ属 (&italic(){Ursus sensu} Zhang & Ryder 1994)
+++++†ホラアナグマ (&italic(){Ursus spelaeus})
+++++N.N.
++++++ホッキョクグマ (&italic(){Ursus maritimus} = &italic(){Thalarctos} = &italic(){Thalarctos maritimus})
++++++ヒグマ (&italic(){Ursus arctos})
+++ナマケグマ (&italic(){Ursus ursinus} = &italic(){Melursus} = &italic(){Melursus ursinus})
クマ属の範囲に
2010-06-12T02:30:10+09:00
1276277410
-
イタチ科
https://w.atwiki.jp/clade/pages/79.html
↑[[食肉類]]
*Koepfli et al. 2008
**亜科
+イタチ科 (Mustelidae)
++アメリカアナグマ亜科 (Taxidiinae) = アメリカアナグマ (&italic(){Taxidea taxus})
++N.N.
+++ラーテル亜科 (Mellivorinae) = ラーテル (&italic(){Mellivora capensis})
+++N.N.
++++N.N.
+++++アナグマ亜科 (Melinae)
+++++&italic(){テン亜科} (Martinae)
++++N.N.
+++++&italic(){イタチアナグマ亜科} (Helictidinae) = イタチアナグマ属 (&italic(){Melogale})
+++++N.N.
++++++&italic(){グリソン亜科} (Galictis)
++++++N.N.
+++++++イタチ亜科 (Mustelinae &italic(){sensu stricto})
+++++++カワウソ亜科 (Lutrinae)
イタチ科の亜科は2~15に分ける説がありましたが、8亜科が適切なようです。
-[[Koepfli et al. 2008. Multigene phylogeny of the Mustelidae: Resolving relationships, tempo and biogeographic history of a mammalian adaptive radiation.>>http://www.biomedcentral.com/1741-7007/6/10]]
**属
+イタチ科 (Mustelidae)
++アメリカアナグマ亜科 (Taxidiinae) = アメリカアナグマ (&italic(){Taxidea taxus})
++N.N.
+++ラーテル亜科 (Mellivorinae) = ラーテル (&italic(){Mellivora capensis})
+++N.N.
++++N.N.
+++++アナグマ亜科 (Melinae)
++++++アナグマ (&italic(){Meles} = &italic(){Meles meles s
2010-06-12T02:29:58+09:00
1276277398